UMIN試験ID | UMIN000043823 |
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受付番号 | R000050017 |
科学的試験名 | 唾液細菌叢解析における検体保存環境が細菌叢プロファイルに与える影響 |
一般公開日(本登録希望日) | 2021/04/02 |
最終更新日 | 2023/01/04 11:17:28 |
日本語
唾液細菌叢解析における検体保存環境が細菌叢プロファイルに与える影響
英語
Influence of preservation environments on salivary microbiota profiles in 16S rRNA sequencing
日本語
唾液細菌叢解析における検体保存環境が細菌叢プロファイルに与える影響
英語
Influence of preservation environments on salivary microbiota profiles in 16S rRNA sequencing
日本語
唾液細菌叢解析における検体保存環境が細菌叢プロファイルに与える影響
英語
Influence of preservation environments on salivary microbiota profiles in 16S rRNA sequencing
日本語
唾液細菌叢解析における検体保存環境が細菌叢プロファイルに与える影響
英語
Influence of preservation environments on salivary microbiota profiles in 16S rRNA sequencing
日本/Japan |
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健常者
英語
Healthy subjects
成人/Adult |
悪性腫瘍以外/Others
いいえ/NO
日本語
メタ16S rRNA細菌叢解析において、唾液サンプルの保存環境が解析結果に与える影響を調査すること
英語
To compare the microbial profiles based on 16S rRNA sequencing between storing temperatures
生物学的・臨床的同等性/Bio-equivalence
日本語
英語
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細菌叢プロファイル
英語
Microbial profiles based on 16S rRNA amplicon sequencing
日本語
英語
観察/Observational
日本語
英語
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英語
日本語
英語
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英語
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英語
日本語
英語
日本語
英語
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英語
日本語
英語
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英語
20 | 歳/years-old | 以上/<= |
適用なし/Not applicable |
男女両方/Male and Female
日本語
2017年4月1日から2019年3月31日までの間に研究課題名「消化器疾患における炎症・発癌・機能障害と細菌叢との関連性に関する研究」(UMIN000040192)に参加し唾液細菌叢解析を実施した被験者
英語
Subjects who participated in the study entitled "Association of gut microbiota with inflammation, cancer, or dysfunction in gastrointestinal diseases UMIN000040192" from April 1, 2017 to March 31, 2019, and underwent salivary microbiota analysis.
日本語
1. 各保存環境での保存を実施せずあるいは不可能であった者
2. オプトアウトにより参加拒否を申し出た者
英語
1. those whose salivary samples were not or could not be stored in the respective storage environments
2. those who refused to participate by opting out
5
日本語
名 | 広人 |
ミドルネーム | |
姓 | 古橋 |
英語
名 | Hiroto |
ミドルネーム | |
姓 | Furuhashi |
日本語
東京慈恵会医科大学
英語
The Jikei University School of Medicine
日本語
内視鏡医学講座
英語
Department of Endoscopy
1058471
日本語
東京都港区西新橋3-25-8
英語
3-25-8, Nishi-Shimbashi, Minato-ku, Tokyo
0336331111
ms04furuhashi@jikei.ac.jp
日本語
名 | 広人 |
ミドルネーム | |
姓 | 古橋 |
英語
名 | Hiroto |
ミドルネーム | |
姓 | Furuhashi |
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東京慈恵会医科大学
英語
The Jikei University School of Medicine
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内視鏡医学講座
英語
Department of Endoscopy
1058471
日本語
東京都港区西新橋3-25-8
英語
3-25-8, Nishi-Shimbashi, Minato-ku, Tokyo
0336331111
ms04furuhashi@jikei.ac.jp
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東京慈恵会医科大学
英語
The Jikei University School of Medicine
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英語
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東京慈恵会医科大学
英語
The Jikei University School of Medicine
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自己調達/Self funding
日本語
英語
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英語
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英語
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東京慈恵会医科大学
英語
The Jikei University School of Medicine
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東京都港区西新橋3-25-8
英語
3-25-8, Nishi-Shimbashi, Minato-ku, Tokyo
0336331111
rinri@jikei.ac.jp
いいえ/NO
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英語
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英語
2021 | 年 | 04 | 月 | 02 | 日 |
None
最終結果が公表されている/Published
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/eos.12852
5
日本語
即時抽出群と-15℃群の間には、属およびOTUレベルでの相対的存在量について、ほぼ完全な相関が示された。保存方法間の個体内UniFrac距離は、個体間距離よりも有意に短かった。また、抽出されたDNA量、α多様性指標、門・属・OTUレベルの相対的豊富度には、保存方法による違いはなかった。
英語
An almost perfect correlation was shown between the immediate extraction and the -15 degree storage group for relative abundance at the genus and operational taxonomic unit levels. The intraindividual UniFrac distances among storage methods were significantly shorter than those of interindividual distances. None of the amount of extracted DNA, the alfa-diversity indices, or the relative abundance at the phylum/genus/operational taxonomic unit level differed among storage methods.
2023 | 年 | 01 | 月 | 04 | 日 |
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英語
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5人の健常者
英語
5 healthy subjects
日本語
MiSeq Illuminaプラットフォームを用いて、3つの異なる保存環境(瞬間冷凍後-80℃、-80℃、-15℃;いずれも14日間)における微生物叢プロファイルの頑健性を、即時DNA抽出と比較して評価する観察研究を実施した。
英語
We performed an observational study to assess the robustness of microbiota profiles in three different storage environments (-80 degree after flash-freezing, -80 degree, and -15 degree; all for 14 days) compared to immediate DNA extraction using the MiSeq Illumina platform
日本語
なし
英語
None
日本語
抽出されたDNA量
α多様性指標
門・属・OTUレベルの相対的豊富度
UniFrac距離および主座標解析
英語
Relative abundance at the genus and OTU level
Amount of observed DNA
alfa-diversity indices
UniFrac distance and PCoA
日本語
英語
日本語
英語
試験終了/Completed
2020 | 年 | 10 | 月 | 04 | 日 |
2020 | 年 | 12 | 月 | 07 | 日 |
2020 | 年 | 12 | 月 | 07 | 日 |
2020 | 年 | 12 | 月 | 07 | 日 |
日本語
特記事項なし
英語
Not applicable
2021 | 年 | 04 | 月 | 02 | 日 |
2023 | 年 | 01 | 月 | 04 | 日 |
日本語
https://center6.umin.ac.jp/cgi-open-bin/ctr/ctr_view.cgi?recptno=R000050017
英語
https://center6.umin.ac.jp/cgi-open-bin/ctr_e/ctr_view.cgi?recptno=R000050017
研究計画書 | |
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登録日時 | ファイル名 |
研究症例データ仕様書 | |
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登録日時 | ファイル名 |
研究症例データ | |
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登録日時 | ファイル名 |